Dispositions harmonisées en matière d'assurance et de contrôle de la qualité afin d'évaluer l'exhaustivité et la robustesse du prétraitement des données MS1 pour le dépistage suspects et l'analyse non ciblée par LC-HRMS

L'analyse non ciblée et suspecte, utilisant la chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse à haute résolution, représente une méthode très prometteuse pour caractériser de manière exhaustive des mélanges chimiques complexes. Le prétraitement des données est une partie cruciale du processus, mais certaines limites sont observées : (i) la sélection et l'extraction des pics peuvent être incomplètes, en particulier pour les composés peu abondants, et (ii) une reproductibilité limitée a été observée entre les laboratoires et les logiciels pour les pics détectées et leur quantification relative. Nous avons d'abord procédé à un examen critique des solutions existantes susceptibles d'améliorer la reproductibilité du prétraitement pour la chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse à haute résolution. Les solutions consistent à fournir des référentiels et des lignes directrices en matière de rapports, des workflows de traitement modulaires et en libre accès, des ensembles de données de référence publiques, des outils permettant d'optimiser le prétraitement des données et de filtrer les fausses détections positives. Nous proposons ensuite des lignes directrices harmonisées en matière d'assurance et de contrôle de la qualité qui permettraient d'évaluer la sensibilité de la détection des pics, la reproductibilité, la précision de l'intégration, la précision, l'exactitude et la cohérence du prétraitement des données pour la biosurveillance humaine, les communautés alimentaires et environnementales.